В коллекции хранятся почвы от Арктики до Новой Зеландии. Ежегодно сотрудники Музея выезжают в экспедиции для пополнения коллекции и сбора научного материала. Музей является научно-исследовательским и научно-просветительским учреждением, в соответствии с замыслом В. В. Докучаева.